一、對于合同爭議的不同主張，仲裁機構如何進行裁決？

法律分析：仲裁機構的裁決應當基于雙方當事人的意思自治原則和平等自愿原則。如果當事人雙方在合同爭議上存在不同的主張，仲裁機構應當依據事實、合同約定和相關法律法規作出公正、合理的裁決。

法律依據：

1.《中華人民共和國仲裁法》第三十三條：“仲裁機構在裁決時，應當以雙方當事人的意思自治原則和平等自愿原則為基礎，在遵守法律、法規的前提下，根據合同約定，綜合考慮案件的事實、證據，公正、合理地作出裁決。”

2.《中華人民共和國合同法》第九十二條：“當事人一方主張合同有效而另一方主張合同無效的，仲裁機構或者人民法院應當依法判斷合同是否有效。”

3.《中華人民共和國合同法》第十一條：“訂立合同要遵循自愿、平等、公平和誠實信用原則。”

二、仲裁協議約定了兩個仲裁機構,仲裁協議有效嗎

法律分析：仲裁協議約定了兩個仲裁機構，當事人協商選擇其中一個仲裁機構的，仲裁協議有效；當事人不能就選擇仲裁機構達成一致的，協議無效。

法律依據：《最高人民法院關于適用若干問題的解釋》 第五條 仲裁協議約定兩個以上仲裁機構的，當事人可以協議選擇其中的一個仲裁機構申請仲裁;當事人不能就仲裁機構選擇達成一致的，仲裁協議無效。

三、合同約定爭議解決方式為仲裁

法律分析：合同中約定了爭議解決方式為仲裁和訴訟的，發生爭議時，仲裁協議無效。用仲裁解決爭議必須先有書面約定。在合同糾紛中雙方若要通過仲裁的方式解決糾紛，必須有明確的約定仲裁協議或條款。一般是在雙方事先簽訂的合同中解決爭議的方式中明確選擇仲裁的方式。

法律依據：《中華人民共和國仲裁法》 第四條 當事人采用仲裁方式解決糾紛，應當雙方自愿，達成仲裁協議。沒有仲裁協議，一方申請仲裁的，仲裁委員會不予受理。

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